dede应该是国内被黑的最多的网站程序了，没有之一，模板多，用的人多，黑客研究的多，因是免费的，不收费，开发人员没收益就一直没有加强程序的安全加固修改。
在修改前先备份下网站，以免误删网站
第一、安装的时候数据库的表前缀，最好改一下，不用dedecms默认的前缀dede_,可以改成ljs_,随便一个名称即可。
第二、后台登录开启验证码功能，将默认管理员admin删除，改成一个自己专用的，复杂点的账号，管理员密码一定要长，至少8位，而且字母与数字混合。
第三、装好程序后务必删除install目录。
第四、将dedecms后台管理默认目录名dede改掉。
第五、用不到的功能一概关闭，比如会员member文件夹、留言功能等，如果没有用到，可直接删除文件夹。
第六、以下一些是可以删除的目录（在乐道主机根目录public_html下可以看到）：
member会员功能
special专题功能
company企业模块
plus\guestbook留言板
第七、plus文件夹
留下这么几个文件，其他全部删除，参考下图：
以下是可以删除的文件：
dede管理目录下的这些文件是后台文件管理器，属于多余功能，而且最影响安全,许多HACK都是通过它来挂马的
file_manage_control.php
file_manage_main.php
file_manage_view.php
media_add.php
media_edit.php
media_main.php
再有：
不需要SQL命令运行器的将dede/sys_sql_query.php 文件删除。
不需要tag功能请将根目录下的tag.php删除。不需要顶客请将根目录下的digg.php与diggindex.php删除。
第七、多关注dedecms官方发布的安全补丁，及时打上补丁。
第八、下载发布功能（管理目录下soft__xxx_xxx.php），不用的话可以删掉，这个也比较容易上传小马的。
第九、DedeCms官网出的万能安全防护代码,登录dedecms官网论坛查看。
第十、最安全的方式：本地发布html，然后上传到空间。不包含任何动态内容，理论上最安全，不过维护相对来说比较麻烦。
第十一，得经常检查自己的网站，被挂黑链是小事，被挂木马或删程序就很惨了，运气不好的话，排名也会跟着掉。所以还得记得时常备份网站。
如你的dede网站已被黑可参考：DedeCMS织梦顽固木马后门专杀工具（适用织梦程序被挂码、入侵的检查和清理）